La fonctionnalisation de surface permet d'immobiliser des récepteurs moléculaires sur des surfaces et de former alors des complexes d'inclusion par chimie supramoléculaire ce qui permet diverses applications. Le but du présent travail était d'étudier le processus d'association entre une molécule invitée, un dérivé de type azobenzène, et différentes molécules hôtes lorsque ces dernières sont greffées sur une surface d'or. Ces études ont été menées par la simulation numérique de type dynamique moléculaire. En phase homogène, ces simulations ont permis une caractérisation structurale au niveau microscopique de ces systèmes. En couplant les simulations à des calculs de PMF, les propriétés thermodynamiques d'association en phase homogène ont été calculées et comparées aux grandeurs expérimentales. L'immobilisation de l'hôte sur une surface apporte une modification de la structure de l'hôte. Cette modification a été étudiée en fonction de la longueur des chaînes de greffage et aussi du nombre de points d'ancrage. Les grandeurs d'association en phase hétérogène ont également été obtenues grâce aux PMF. Elles ont été interprétées à l'aide d'une caractérisation structurale et énergétique des processus mis en jeu. La comparaison des résultats structuraux et thermodynamiques obtenus en phase homogène et hétérogène a révélé un impact significatif du greffage sur les processus d'association.