La visualisation moléculaire permet aux biochimistes de mieux appréhender la structure spatiale et les fonctions des macro-molécules biologiques. Les outils de visualisation (PyMol, VMD, Raster3D, PMV, Chimera) offrent des moyens puissants pour répondre à la problématique de la visualisation moléculaire. Cependant, ces outils n’ont pas la même flexibilité qu’un outil développé ex-nihilo, pour lequel il sera plus simple d’ajouter des fonctionnalités spécifiques en fonction de l’architecture cible. Sibmol3D est un outil basique, développé en Qt et OpenGL, permettant la visualisation de la géométrie des molécules décrites au moyen du format de fichier standard PDB (Protein Data Bank). Il existe trois modes de visualisation, la projection orthogonale, la projection en perspective et la projection en perspective stéréoscopique au moyen de lunettes pour anaglyphes.